Équipe Julie PANNEQUIN
Signalisation, Plasticité et Cancer

L’équipe travaille sur les mécanismes moléculaires impliqués dans différentes étapes de progression du cancer colorectal (CRC) afin de potentiellement trouver de nouvelles cibles thérapeutiques. Grâce à des interactions étroites avec les cliniciens de l’équipe et des technologies de pointe, les différents projets translationnels portent sur une meilleure compréhension du rôle du microenvironnement dans l’hétérogénéité précoce des tumeurs, les mécanismes mis en œuvre par les cellules tumorales ainsi que les cellules souches cancéreuses, pour résister aux traitements, et finalement les mécanismes impliqués dans la dissémination et la récidive du CRC.

L’équipe travaille sur plusieurs étapes du cancer du côlon : l’implication de l’hétérogénéité des adénomes colorectaux dans la progression en cancer, les mécanismes de dissémination vers les organes métastatiques, le rôle des cellules souches cancéreuses dans la résistance aux traitements, et les mécanismes impliqués dans la récidive. L’équipe utilise des techniques de pointes, des modèles in vivo et in vitro en organoïdes 3D et des outils bio-informatiques pour une recherche translationnelle et la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques.



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2010Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) - Université de Montpellier - France
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2001Doctorat en Biologie-Santé - Université de Montpellier - France
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2018-Directrice de Recherche au CNRS (DR2)
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2012-Directrice de l’équipe "Signalisation, Plasticité et Cancer" - Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF) - Montpellier - France
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2008Chargée de Recherche au CNRS (CR1) - Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF) - Montpellier - France
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2007-2008Chef de projet (CDI) - BioRéalités - Montpellier - France
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1998-2001Doctorante (Dir. J. Martinez) - Laboratoire des Peptides et Protéines (LAPP, UMR 5810) - Faculté de Pharmacie - Montpellier - France
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2017Prix Gallet et Breton décerné par l’Académie de Médecine
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2015Prix "Chercheur d’avenir" décerné par la région Languedoc Roussillon
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2015Prix "Pierre et Marie-Thérèse Durand" décerné par la Société Française de Gastroentérologie
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2008Prix Jeune Chercheur "Jean & Madeleine Schaeverbeke" de la Fondation de France
- Je travaille depuis plus de 20 ans dans le domaine du cancer du côlon avec un focus sur deux enjeux cliniques majeurs que sont la récidive tumorale et la dissémination qui mène à la formation de métastases. Mes sujets d’intérêt sont l’hétérogénéité et la plasticité tumorales qui sont très largement impliquées dans la récidive et la formation des métastases. Dans ce contexte je suis un des membres fondateurs du réseau Sunrise (https://www.sunrise-network.fr/) pour fédérer les chercheurs, les cliniciens et les industriels sur cette thématique.
- J’ai dédié de nombreuses années à la génération de modèles in vitro et in vivo qui soient pertinents pour la pathologie humaine.
- Les techniques les plus utilisées dans mon laboratoire sont de la cytométrie, des immunomarquages, de la biologie moléculaire et plus récemment le scRNAseq et la transcriptomique spatiale.
- J’ai de nombreuses collaborations avec des cliniciens et ai même intégré une oncologue digestive dans l’équipe afin de mener une recherche translationnelle pertinente.



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2013Doctorat en Biomédecine - Universitat Pompeu Fabra - UPF - Barcelone - Espagne
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2009Master en Recherche Biomédicale - Universitat Pompeu Fabra - UPF - Barcelone - Espagne
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2008Licence en Biologie Humaine - Universitat Pompeu Fabra - UPF - Barcelone - Espagne
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2023-Chargé de Recherche au CNRS (CRCN) - Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF) - Montpellier - France
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2017-Professeur Associé - Master en Bioinformatique et Biostatistique - Universitat Oberta de Catalunya (UOC) - Barcelone - Espagne
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2023Chercheur postdoctoral - Groupe Signalisation, Plasticité et Cancer - Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF) - Montpellier - France
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2021-2022Chercheur postdoctoral - Groupe Bioinformatique du Cancer et Biologie des Systèmes - Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM) - Montpellier - France.
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2018-2021Associé de Recherche - Département de Génétique Médicale - Université de Cambridge - Royaume-Uni
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2016-2018Chercheur postdoctoral - Laboratoire de Recherche Translationnelle sur le Cancer du Foie - Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS) - Barcelone - Espagne
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2013-2016Chercheur postdoctoral - Institut de Recherche Cardiovasculaire / Institut de Génétique Humaine - Université de Californie San Francisco (USCF) -USA
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2009-2013Doctorant - Laboratoire de Génomique et Maladies - Centre de Régulation Génomique (CRG) - Universitat Pompeu Fabra - Barcelone - Espagne
- - Analyse informatique des données de séquençage de nouvelle génération (DNA sequencing, bulk RNA sequencing, single-cell RNA sequencing)
- - Développement d'outils bioinformatiques pour l'analyse génomique et transcriptomique du cancer
- - Rôle de l'aneuploïdie et d'autres variantes génomiques structurelles dans l'initiation et la progression du cancer
- - Impact de l'aneuploïdie et d'autres variants génomiques structurels dans la formation du microenvironnement tumoral







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2009Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) - Université de Montpellier - France
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2000Doctorat - Biochimie & Biologie Cellulaire - Université de Montpellier - France
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2012-Chargé de Recherche INSERM - Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier - France
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2001-2012Chargé de Recherche INSERM - INSERM U632 - Montpellier - France
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2000-2001Postdoctorant - NIEHS - Université de Caroline du Nord - Durham - USA
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1997-2000Doctorant - INSERM U128 - Montpellier - France
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2005Prix ISSX du Nouveau Chercheur Européen en l'honneur de Karl J. Netter
- Mes études portent sur la récidive du cancer, les cellules souches cancéreuses, le cancer colorectal, le récepteur nucléaire Pregnane X (NR1I2) et les PROTACs.
- Techniques de laboratoire
- Cultures de lignées cellulaires et cultures primaires
- Biologie moléculaire : PCR, qPCR, Western Blot, EMSA, Cytométrie et trieurs de cellules
- Travail en secteur L2
- Concepteur (Niveau 1) et Chirurgie












































- Homayed Z, Belthier G, Lahlou T, Bassaganyas L, Sidot E, Giroux P, Series J, Bouclier C, Bansard L, Gerbe F, Pan C, Newger M, Bourgaux JF, Guillermet-Guibert J, Lacroix M, Le Cam L, Fre S, Ridgway R, Sansom OJ, Erturk A, Jay P, Häußler D, Krüger A, Werb Z, Turtoi A, Gregoire D, Lagarrigue F, Bonnans C and Pannequin J. Early Dissemination Highly Enhances Liver Metastasis Development During Intestinal Tumorigenesis. Cancer Cell. In press.
- Therizols G, Bash-Imam Z, Panthu B, Machon C, Vincent A, Ripoll J, Nait-Slimane S, Chalabi-Dchar M, Gaucherot A, Garcia M, Laforêts F, Marcel V,Boubaker-Vitre J, Monet MA, Bouclier C, Vanbelle C, Souahlia G, Berthel E,Albaret MA, Mertani HC, Prudhomme M, Bertrand M, David A, Saurin JC, Bouvet P,Rivals E, Ohlmann T, Guitton J, Dalla Venezia N,Pannequin J, Catez F, Diaz JJ.Alteration of ribosome function upon 5-fluorouracil treatment favors cancer celldrug-tolerance. Nat Commun. 2022 Jan 10;13(1):173. doi:10.1038/s41467-021-27847-8. PMID: 35013311;
- Belthier G, Homayed Z, Grillet F, Duperray C, Vendrell J, Krol I, Bravo S,Boyer JC, Villeronce O, Vitre-Boubaker J, Heaug-Wane D, Macari-Fine F, Smith J,Merlot M, Lossaint G, Mazard T, Portales F, Solassol J, Ychou M, Aceto N,Mamessier E, Bertucci F, Pascussi JM, Samalin E, Hollande F, Pannequin J. CD44v6Defines a New Population of Circulating Tumor Cells Not Expressing EpCAM.Cancers (Basel). 2021 Oct 2;13(19):4966. doi: 10.3390/cancers13194966. PMID:34638450;
- Mitoyan L, Chevrier V, Hernandez-Vargas H, Ollivier A, Homayed Z, PannequinJ, Poizat F, De Biasi-Cador C, Charafe-Jauffret E, Ginestier C, Guasch G. A stemcell population at the anorectal junction maintains homeostasis and participatesin tissue regeneration. Nat Commun. 2021 May 12;12(1):2761. doi:10.1038/s41467-021-23034-x. PMID: 33980830;
- Giraud J, Foroutan M, Boubaker-Vitre J, Grillet F, Homayed Z, Jadhav U,Crespy P, Breuker C, Bourgaux JF, Hazerbroucq J, Pignodel C, Brulin B,Shivdasani RA, Jay P, Hollande F, Pannequin J. Progastrin production transitionsfrom Bmi1+/Prox1+ to Lgr5high cells duringearly intestinal tumorigenesis. Transl Oncol. 2021 Feb;14(2):101001. doi:10.1016/j.tranon.2020.101001. Epub 2020 Dec 23. PMID: 33360299;
- Müller S, Versini A, Sindikubwabo F, Belthier G, Niyomchon S, Pannequin J,Grimaud L, Cañeque T, Rodriguez R. Metformin reveals a mitochondrial copperaddiction of mesenchymal cancer cells. PLoS One. 2018 Nov26;13(11):e0208213. PMID: 30399175;
- Grillet F, Bayet E, Villeronce O, Zappia L, Lagerqvist EL, Lunke S, Charafe-Jauffret E, Pham K, Molck C, Rolland N, Bourgaux JF, Prudhomme M, Philippe C,Bravo S, Boyer JC, Canterel-Thouennon L, Taylor GR, Hsu A, Pascussi JM, Hollande F, Pannequin J. Circulating tumour cells from patients with colorectal cancer have cancer stem cell hallmarks in ex vivo culture. 2017Oct;66(10):1802-1810. doi: 10.1136/gutjnl-2016-311447. Epub 2016 Jul 25. PMID:27456153;
- Planque C, Rajabi F, Grillet F, Finetti P, Bertucci F, Gironella M, LozanoJJ, Beucher B, Giraud J, Garambois V, Vincent C, Brown D, Caillo L, Kantar J,Pelegrin A, Prudhomme M, Ripoche J, Bourgaux JF, Ginestier C, Castells A,Hollande F, Pannequin J, Pascussi JM. Pregnane X-receptor promotes stem cell-mediated colon cancer relapse. 2016 Aug 30;7(35):56558-56573. doi:10.18632/oncotarget.10646. PMID: 27448961;
- Giraud J, Failla LM, Pascussi JM, Lagerqvist EL, Ollier J, Finetti P,Bertucci F, Ya C, Gasmi I, Bourgaux JF, Prudhomme M, Mazard T, Ait-Arsa I,Houhou L, Birnbaum D, Pélegrin A, Vincent C, Ryall JG, Joubert D, Pannequin J,Hollande F. Autocrine Secretion of Progastrin Promotes the Survival and Self-Renewal of Colon Cancer Stem-like Cells. Cancer Res. 2016 Jun 15;76(12):3618-28. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-15-1497. Epub 2016 May 4. PMID: 27197176.
Hétérogénéité et plasticité dans la dissémination et la résistance tumorale
Responsable
Julie PANNEQUIN
Développement de stratégies innovantes ciblant le récepteur nucléaire PXR pour le traitement du cancer colorectal
Responsable
Jean-Marc PASCUSSI
Etude du rôle du microenvironnement dans l’hétérogénéité tumorale et la dissémination précoce du cancer colorectal
Responsable
Caroline BONNANS
Surveillance de l’ADN tumoral circulant (ADNct) pour l’analyse des récidives du cancer colorectal
Responsable
Laia BASSAGANYAS