Plateforme PPM-FPP
Protéomique Fonctionnelle
Le Pôle Protéome de Montpellier (PPM) est l’une des plateformes en sciences du vivant de l’Unité d’Appui à la Recherche BioCampus Montpellier. Le PPM fédère 4 sites de compétences en analyse protéomique, dont le site FPP de Protéomique Fonctionnelle qui est hébergé à l’Institut de Génomique Fonctionnelle.
Le PPM est l’un des 6 nœuds de l’infrastructure nationale en protéomique ProFi. Il est labellisé IBiSA depuis 2009 et certifié ISO 9001:2015 depuis 2015.
Le site FPP de protéomique fonctionnelle du PPM propose une double expertise et des technologies de pointe en :
• Spectrométrie de masse à haute résolution dédiée à l’identification et la quantification de protéines, à l’analyse différentielle (avec ou sans marquage) ou encore à la recherche de partenaires protéiques.
• Protéomique structurale pour l’étude des interactions protéines-protéines et ligands protéines ainsi que leur dynamique structurale dans des conditions natives.
Expertises et services
• Préparation d’échantillons biologiques (purification, séparation, enrichissement et préfractionnement) pour les analyses de spectrométrie de masse,
• Protéomique quantitative ciblée et à large échelle,
• Analyse structurale par spectrométrie de masse,
• Etude des modifications post-traductionnelles,
• Etudes interactomiques basées sur la spectrométrie de masse,
• Découverte et validation de biomarqueurs basées sur la spectrométrie de masse,
• Analyse bioinformatique et statistique des données produites.
Prise de contact
Pour toute demande de prestation de service ou de collaboration scientifique, veuillez prendre contact avec la plateforme en décrivant succinctement votre demande.
Une réunion en présence du personnel de la plateforme vous sera proposée dans les meilleurs délais pour échanger sur la faisabilité de votre projet, les stratégies et techniques à utiliser et la nature des services que la plateforme peut vous offrir. Lors de cet échange, le financement et le type de projet (prestation ou collaboration) seront également définis selon les termes de la charte du PPM. Le délai nécessaire à la réalisation des projets varie selon le type de service sollicité.
Source d’ionisation NanoSpray (Thermo Fisher Scientific)
IGF Sud 025
04 34 35 93 24
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2012Doctorat en Biochimie - Université Pierre et Marie Curie - Paris - France
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2009Master "Protéomique Structurale et Fonctionnelle" - Université Pierre et Marie Curie - Paris - France
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2008Maîtrise en Biochimie - Université Libanaise - Beyrouth - Liban
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2023-Professeure des Universités, section CNU64 - Université de Montpellier - France
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2015-2023Maître de Conférences, section CNU64 - Université de Montpellier - France
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2012-2015Postdoctorat - Prof. Dame C.V. Robinson' group - Université d’Oxford - Royaume-Uni
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2009-2012Thèse - Laboratoire des Biomolécules UMR7203 - Paris - France
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2023Prix de la Recherche, Société Française de Spectrométrie de Masse
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2023-Élue représentante des enseignants-chercheurs de l’axe "Biologie Quantitative", Pôle Biologie-Santé, Université de Montpellier
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2021-Co-responsable du parcours "Quantitative Biology", Master Biologie-Santé - Université de Montpellier
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2020-2025Membre Junior de l’Institut Universitaire de France
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2019-Responsable applications Spectrométrie de Masse structurale, FPP, PPM
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2009-2012Bourse de thèse "Ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche"
- Je suis biochimiste spécialisée dans l'application des approches de spectrométrie de masse structurale pour étudier la structure, dynamique et interactions des protéines.
- Mes études visent à caractériser la structure et la dynamique des récepteurs couplés aux protéines G, principale cible de médicaments, ainsi que leurs partenaires d’interaction. Pour ce faire, je combine les outils innovants de spectrométrie de masse structurale avec d’autres approches biophysiques et biochimiques plus "classiques".
- Mon projet principal vise à déchiffrer le rôle des GPCRs dans les interactions hôte/pathogène en utilisant la spectrométrie de masse native, l’échange hydrogène/deutérium, la pharmacologie ainsi que la biologie structurale. Cette étude permettra d'approfondir notre connaissance de ces récepteurs, tout en nous proposant une stratégie thérapeutique alternative pour lutter contre la résistance antimicrobienne.
- De plus, je collabore avec différentes équipes nationales et internationales pour analyser diverses protéines cibles par spectrométrie de masse structurale, afin de déterminer et caractériser leurs stœchiométries, modifications conformationnelles et partenaires d’interaction.
IGF Sud 029 04 34 35 92 17
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2016HDR - Université de Montpellier - France
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2004Doctorat en Biologie Moléculaire et Cellulaire - Université de Montpellier - France
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2009-Maître de Conférences - Institut de Génomique Fonctionnelle - Université de Montpellier - France
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2007-2009Stage postdoctoral (Dir. Dr M. Garret) - Institut de Neurosciences Cognitives et Intégratives d’Aquitaine (INCIA) - Bordeaux - France
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2006-2007Stage postdoctoral (Dir. Dr B. Khakh) - David Geffen School of Medicine, Department of Physiology and Neurobiology - University of California Los Angeles - États-Unis
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2004-2006Stage postdoctoral (Dir. Dr B. Khakh) - Laboratory of Molecular Biology - Cambridge - Angleterre
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2001-2004Thèse (Dir. F. Rassendren) - Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier - France
- Directrice Adjointe de l’UAR BioCampus
- Co-responsable scientifique du Plateau de Protéomique Fonctionnelle (FPP)
- Co-responsable pour l’Université de Montpellier des relations avec les partenaires institutionnels LAS
- Spécialiste de biologie moléculaire, biochimie et neuroprotéomique. Mon projet porte sur l'étude des rôles neurodéveloppementaux du récepteur 5-HT6 de la sérotonine, cible émergente pour le traitement des déficits cognitifs associés aux pathologies neurodéveloppementales.
IGF Sud 029 04 34 35 92 17
IGF Sud 029 04 34 35 92 17
IGF Sud 029 04 34 35 92 17
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2006Doctorat - Biochimie - Université de Rouen - France
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2012-Ingénieur de Recherche CNRS – Unité d’Appui et de Recherche (UAR) BioCampus – Plateforme Protéome de Montpellier (PPM, https://www.ppm.cnrs.fr/) – Montpellier – France
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2007-2012Ingénieur de Recherche CNRS – Institut Fédératif de Recherche 3 – Plateforme Protéome – Montpellier – France
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2002-2006Ingénieur d’études – Laboratoire coopératif Medicago Europa-UMR CNRS 6037 – Rouen – France
- Distinctions
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2023Médaille de cristal du CNRS
- Responsabilités
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2021-Responsable Scientifique PPM – UAR BioCampus - Montpellier – France
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2014-2020Responsable Opérationnel PPM – UAR BioCampus - Montpellier - France
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2008-2013Responsable Technique plateau FPP - Institut Fédératif de Recherche 3 – Montpellier – France
- Principales techniques maitrisées
- Biochimie
- Spectrométrie de masse
- Chromatographie liquide
- Analyse de données
- Logiciels d’analyse protéomique
IGF Sud 029 04 34 35 92 17
IGF Sud 029 04 34 35 92 17
IGF Nord 207c 04 34 35 92 64
Publications majeures
- Picard MAL, Leblay F, Cassan C, Willemsen A, Daron J, Bauffe F, Decourcelle M, Demange A, Bravo IG. Transcriptomic, proteomic and functional consequences of codon usage bias in human cells during heterologous gene expression. Protein Sci. 2023 Mar;32(3):e4576. doi: 10.1002/pro.4576. PMID: 36692287
- Rebendenne A, Roy P, Bonaventure B, Chaves Valadão AL, Desmarets L, Arnaud-Arnould M, Rouillé Y, Tauziet M, Giovannini D, Touhami J, Lee Y, DeWeirdt P, Hegde M, Urbach S, Koulali KE, de Gracia FG, McKellar J, Dubuisson J, Wencker M, Belouzard S, Moncorgé O, Doench JG, Goujon C. Bidirectional genome-wide CRISPR screens reveal host factors regulating SARS-CoV-2, MERS-CoV and seasonal HCoVs. Nat Genet. 2022 Aug;54(8):1090-1102. doi: 10.1038/s41588-022-01110-2. Epub 2022 Jul 25. PMID: 35879413
- Lambey P, Otun O, Cong X, Hoh F, Brunel L, Verdié P, Grison CM, Peysson F, Jeannot S, Durroux T, Bechara C, Granier S, Leyrat C. Structural insights into recognition of chemokine receptors by Staphylococcus aureus leukotoxins. 2022 Mar 21;11:e72555. doi: 10.7554/eLife.72555. PMID: 35311641
- Al Awabdh S, Donneger F, Goutierre M, Séveno M, Vigy O, Weinzettl P, Russeau M, Moutkine I, Lévi S, Marin P, Poncer JC. Gephyrin interacts with the K-Cl co-transporter KCC2 to regulate its surface expression and function in cortical neurons. J Neurosci. 2022 Jan 12;42(2):166-182. doi: 10.1523/JNEUROSCI.2926-20.2021. Epub 2021 Nov 22. PMID: 34810232
- Fumagalli A, Heuninck J, Pizzoccaro A, Moutin E, Koenen J, Séveno M, Durroux T, Junier MP, Schlecht-Louf G, Bachelerie F, Schütz D, Stumm R, Smit MJ, Guérineau NC, Chaumont-Dubel S, Marin P. The atypical chemokine receptor 3 interacts with Connexin 43 inhibiting astrocytic gap junctional intercellular communication. Nat Commun. 2020 Sep 25;11(1):4855. doi: 10.1038/s41467-020-18634-y. PMID: 32978390
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