GÉNOMIQUE FONCTIONNELLE DES GÈNES SOUMIS À EMPREINTE GÉNOMIQUE PARENTALE
Département : Biologie du cancer - Axe de recherche : Réseaux moléculaires et cellulaires

 

Thème de recherche

L’empreinte génomique parentale est un mécanisme épigénétique qui réprime l’expression d’un des 2 allèles d’un même gène en fonction de son origine parentale, maternelle ou paternelle. Il affecte une centaine de gènes chez les mammifères placentaires (euthériens), moins d’une dizaine chez les marsupiaux (métathériens) et n’existe pas chez les mammifères ovipares (protothériens) et les clades plus anciens (oiseaux, reptiles, poissons....).

Une altération de l’empreinte génomique de certains loci est responsable de différents syndromes présentant des phénotypes complexes : Silver-Russel, Angelman, Prader-Willi, Beckwith-Wiedemann et TNDM (Transient Neonatal Diabetes Mellitus). D’autre part, un certain nombre de gènes soumis à empreinte sont impliqués dans la formation de tumeurs comme oncogènes ou gènes suppresseur de tumeurs.

La recherche sur l’empreinte génomique s’articule autour de 3 questions principales :

  • Pour quelle(s) raison(s) ce mécanisme atypique de régulation de l’expression génique a-t-il été sélectionné lors de l’évolution des mammifères, à la transition protothériens → métathériens ?
  • Quels sont les mécanismes moléculaires qui assurent le marquage différentiel des allèles maternel et paternel d’un même gène au cours de la gamétogénèse ?
  • Comment ces marques entrainent-elles l’expression monoallélique des ces gènes ?
  • Quelles sont les singularités fonctionnelles de cette centaine de gènes qui pourraient expliquer qu’ils ont été ciblés au cours de l’évolution par l’empreinte génomique ?

Notre équipe essaie de répondre à cette dernière question et cherche à identifier les fonctions moléculaires et les processus biologiques contrôlés par les gènes soumis à empreinte génomique.

 

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Équipe

Chef d'équipe

Laurent Journot
DR2, CNRS


  IGF Sud 021

  04 34 35 92 41

 

Personnel de l'équipe

Tristan Bouschet
CRCN, Inserm


  IGF Sud 022

  04 34 35 92 40

 

Ali Janbain
Doctorant(e), UM


  Fac de pharma

  04 11 75 97 36

 

Anne Le Digarcher
TCE, CNRS


  IGF Sud 022

  04 34 35 92 40

 

Jean Peyhardi
MCF, UM


  Fac de pharma

  04 11 75 97 36

 

Christelle Reynes
MCF, UM


  Fac de Pharma

  04 11 75 96 83

 

Robert Sabatier
PU, UM


  Fac de Pharma

  04 11 75 96 80

 

Annie Varrault
CRCN, CNRS


  IGF Sud 022

  04 34 35 92 40

 

Myrtille Vivien
MCF, UM


  Fac de Pharma

  04 11 75 96 82

 


Publications majeures

  • Varrault A, Eckardt S, Girard B, Le Digarcher A, Sassetti I, Meusnier C, Ripoll C, Badalyan A, Bertaso F, McLaughlin KJ, Journot L, Bouschet T (2017) Mouse parthenogenetic embryonic stem cells with biparental-like expression of imprinted genes generate cortical-like neurons that integrate into the injured adult cerebral cortex. Stem Cells. in press
  • Varrault A, Dantec C, Le Digarcher A, Chotard L, Bilanges B, Parrinello H, Dubois E, Rialle S, Severac D, Bouschet T, Journot L (2017) Identification of Plagl1/Zac1 binding sites and target genes establishes its role in the regulation of extracellular matrix genes and the imprinted gene network. Nucleic Acids Res. 45:10466-80
  • Bouschet T, Dubois E, Reynès C, Kota S, Rialle S, Maupetit-Méhouas S, Pezet M, Le Digarcher A, Nidelet S, Demolombe V, Cavelier P, Meusnier C, Maurizy C, Sabatier R, Feil R, Arnaud P, Journot L, Varrault A (2017) In vitro corticogenesis from embryonic stem cells recapitulates the in vivo epigenetic control of imprinted gene expression. Cereb Cortex. 27:2418-33
  • Al Adhami H, Evano B, Le Digarcher A, Gueydan C, Dubois E, Parrinello H, Dantec C, Bouschet T, Varrault A, Journot L (2015) A systems-level approach to parental genomic imprinting: the imprinted gene network includes extracellular matrix genes and regulates cell cycle exit and differentiation. Genome Res 25:353-67
  • Seibt J, Armant O, Le Digarcher A, Castro D, Ramesh V, Journot L, Guillemot F, Vanderhaeghen P, Bouschet T (2012) Expression at the imprinted dlk1-gtl2 locus is regulated by proneural genes in the developing telencephalon. PLoS One 7:e48675
  • Gabory A, Ripoche MA, Le Digarcher A, Watrin F, Ziyyat A, Forné T, Jammes H, Ainscough J, Surani A, Journot L, Dandolo L (2009) The H19 gene acts as a trans regulator of the imprinted gene network controlling growth in mice. Development 36:3413-21
  • Varrault A, Gueydan C, Delalbre A, Bellmann A, Houssami S, Aknin C, Severac D, Chotard L, Kahli M, Le Digarcher A, Pavlidis P, Journot L (2006) Zac1 regulates an imprinted gene network critically involved in the control of embryonic growth. Dev Cell 11:711-22
  • Bouschet T, Dubois E, Reynès C, Kota S, Rialle S, Maupetit-Méhouas S, Pezet M, Le Digarcher A, Nidelet S, Demolombe V, Cavelier P, Meusnier C, Maurizy C, Sabatier R, Feil R, Arnaud P, Journot L, Varrault A (2016) In vitro corticogenesis from embryonic stem cells recapitulates the in vivo epigenetic control of imprinted gene expression. Cereb Cortex in press
 

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