Institut de
Génomique
Fonctionnelle

Les objectifs majeurs de notre équipe concernent, d’une part, des approches de protéomique d’expression différentielle dans les domaines de la santé et de la biologie cellulaire et, d’autre part, des approches de protéomique fonctionnelle pour l’analyse de réseaux dans la signalisation cellulaire. Une spécificité de cette activité au sein du LGF est d’associer une très bonne expertise en biologie cellulaire, à un fort potentiel en analyse par spectrométrie de masse et à des compétences chimiques qui permettent de proposer des stratégies originales dans l’identification et la quantification des protéines exprimées.

La quantification relative de l’expression des protéines peut être obtenue par analyse densitométrique à partir de gels 2D Plusieurs méthodes de marquage chimique différentiel permettent une analyse par spectrométrie de masse. Nous avons mis au point une méthode de marquage différentiel en pré-digestion, sélectif des lysines par des réactifs amidines. Le model étudié est un sécrétome d’astrocyte non-stimulé. ou stimulé par le LPS (collaboration P. Marin, LGF).

La plate-forme du LGF accueille des programmes en protéomique, au bénéfice de nombreux partenaires du secteur public comme du secteur privé, au plan régional et au delà pour des programmes nationaux et européens. En 2003, ont été traités des programmes issus de 28 équipes académiques et de laboratoires privés, pour des analyses au bénéfice de l’ensemble des partenaires institutionnels.